在重庆巴南区选择运输许可证代办公司，可从以下几个方面着手。

资质与信誉

首先要确保代办公司具备合法的经营资质，可查看其营业执照等相关证件。同时，了解公司的信誉情况，可以通过网络搜索、咨询同行或查看客户评价等方式，了解该公司在业内的口碑和以往的服务质量。一家信誉良好的代办机构，能让您更放心地将业务委托给他们。

专业能力

运输许可证的办理涉及诸多专业知识和复杂流程，所以代办公司的专业能力至关重要。考察其是否有专业的团队，团队成员是否熟悉运输许可证办理的各项政策法规和具体操作流程。可以询问他们以往办理过的类似案例，以此评估其专业水平。

服务质量

优质的服务能让您在办理过程中更加省心。了解代办公司的服务态度，是否能及时响应您的咨询和需求，是否会为您提供全程的指导和跟进服务。良好的服务质量可以有效提高办理效率，减少不必要的麻烦。

收费标准

在选择代办公司时，要明确其收费标准。避免选择收费过高或过低的公司，过高可能增加您的成本，过低则可能存在服务质量不佳或后期有隐性收费的情况。要与代办公司明确各项收费项目和金额，确保收费合理透明。

关于重庆巴南区运输许可证代办机构，在选择时一定要综合考虑以上因素，谨慎做出决策。同时，要注意与代办公司签订详细的服务合同，明确双方的权利和义务，以保障自身的合法权益。

注意事项：在与代办公司沟通时，要详细了解办理时间，避免因时间过长影响业务开展；办理过程中要及时跟进进度，确保代办公司按约定完成任务；保管好与代办公司的所有沟通记录和相关文件，以备不时之需。